Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem30cQ9D4D7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem30cQ9D4D7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms