Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx20Q9D2Y5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms