Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1K7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1K7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1K7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1K7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms