Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms