Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms