Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rnf144aQ925F3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf144aQ925F3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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