Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spdl1Q923A2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms