Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf1Q91VU1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf1Q91VU1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf1Q91VU1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms