Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol9aQ8VDU3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol9aQ8VDU3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms