Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shtn1Q8K2Q9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shtn1Q8K2Q9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms