Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI70

Lrrc20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc20Q8CI70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc20Q8CI70 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc20Q8CI70 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms