Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms