Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q8CC96 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8CC96 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8CC96 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8CC96 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8CC96 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8CC96 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8CC96 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8CC96 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8CC96 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8CC96 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8CC96 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8CC96 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8CC96 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8CC96 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8CC96 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8CC96 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8CC96 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8CC96 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8CC96 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8CC96 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8CC96 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms