Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms