Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr2Q8C8T8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr2Q8C8T8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms