Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc30Q8BVF4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms