Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem260Q8BMD6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem260Q8BMD6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms