Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DseQ8BLI4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DseQ8BLI4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms