Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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