Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp1Q6K1E7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ggnbp1Q6K1E7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms