Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud6aQ6IE21 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6aQ6IE21 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms