Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nlrp4eQ66X19 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms