Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms