Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SynrgQ5SV85 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynrgQ5SV85 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms