Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88aQ5SNZ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms