Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mdc1Q5PSV9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mdc1Q5PSV9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms