Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms