Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdh1bQ5F204 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdh1bQ5F204 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdh1bQ5F204 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms