Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtl5Q5DTT4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms