Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1td1Q587J6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L1td1Q587J6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms