Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spsb3Q571F5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms