Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms