Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl4Q3URY0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl4Q3URY0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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