Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmod2Q3UHZ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms