Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd11Q1RNF8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms