Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc138Q0VF22 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc138Q0VF22 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms