Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms