Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah2Q06986 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms