Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Caprin2Q05A80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms