Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoa1Q00623 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms