Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmklr1P97468 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms