Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bop1P97452 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bop1P97452 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239 ms