Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct3P80318 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct3P80318 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms