Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samsn1P57725 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms