Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp1P52624 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp1P52624 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms