Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa11P50709 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms