Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psen1P49769 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psen1P49769 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psen1P49769 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psen1P49769 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms