Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TfamP40630 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TfamP40630 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TfamP40630 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TfamP40630 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TfamP40630 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TfamP40630 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TfamP40630 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TfamP40630 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TfamP40630 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TfamP40630 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TfamP40630 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TfamP40630 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TfamP40630 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TfamP40630 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TfamP40630 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TfamP40630 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TfamP40630 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TfamP40630 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TfamP40630 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms