Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk2P38575 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms