Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rom1P32958 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rom1P32958 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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